Bon,
Ce que j'ai dit concernait le fichier bottom_shell_ONLY.stl que j'avais initialement vérifié.
Après réexamen, je constate que c'est le fichier top_shell_ONLY.stl que tu as modifié ici, et que je n'avais pas testé.
J'ai donc vérifié le STL original, et même si le résultat ne m'enchante pas (même après affinage, il reste trop d'arêtes) la conversion semble produire un solide valide.
J'en viens donc à la conclusion que ce sont peut-être tes modifications qui produisent le STL défectueux.
Par exemple, le STL contient plusieurs maillages, je peux les séparer avec l'outil Diviser le maillage du menu Architecture --> Outils de l'atelier Arch.
Pourrais-tu poster ton fichier FCStd ici ?